Deportivo Pereira debutó en la categoría A en 1949, en más de cincuenta años nunca ha sido campeón, sus mejores presentaciones son 1974, en 1982, tuvo como alineación a Oscar Hector Quintabani, Echeverri, Victor Longo, Henry Viáfara, Gilberto Cabrera, Farid Perchy, Sergio Cierra, Toro, Benjamín Cardona, Eduardo Emilio Vilarete y Jairo Aguirre, Manzi, Ponciano Castro, Abel Augusto Lobaton, Hernan Villa, Ivan Dario Castañeda.
En 1997 perdió la categoría y se mantuvo tres años en la Segunda División: 1998, 1999 y 2000. Walter Aristizábal ganó el torneo de la B y volvió al a A.
El 26 de marzo del 2009, el Deportivo Pereira pasa a convertirse en Sociedad Anónima avalado por la Federación Colombiana de Fútbol y la División Mayor del Fútbol Colombiano.
